金識原(GenseqPM)感染病原高通量檢測

金匙醫學案例追蹤十:惱人的腸球菌

  • 分類:診斷案例
  • 作者:
  • 來源:
  • 發布時間:2020-04-18 14:50
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【概要描述】 金識原??從一男性患者腦脊液中檢出屎腸球菌(Enterococcus faecium),序列數2173條,基因組覆蓋5.696147%;肺炎克雷伯氏菌(Klebsiella pneumoniae),序列數14條,基因組覆蓋0.038048%。

金匙醫學案例追蹤十:惱人的腸球菌

【概要描述】 金識原??從一男性患者腦脊液中檢出屎腸球菌(Enterococcus faecium),序列數2173條,基因組覆蓋5.696147%;肺炎克雷伯氏菌(Klebsiella pneumoniae),序列數14條,基因組覆蓋0.038048%。

  • 分類:診斷案例
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  • 發布時間:2020-04-18 14:50
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詳情

 

  案例介紹:

 

  患者男,臨床診斷和主訴顱內感染住院治療。

 

  常規檢查:

 

  白細胞計數(WBC):13.5*10^9/L;淋巴細胞比率:8.6;中性粒細胞比率: 80.03;

 

  培養鑒定結果: 陰性

 

  為了進一步明確病原,取患者腦脊液到金匙醫學做金識原??mNGS檢查,送檢一天后,報告反饋結果如下:

 

 

 

  金識原??從患者腦脊液中檢出屎腸球菌(Enterococcus faecium),序列數2173條,基因組覆蓋5.696147%;肺炎克雷伯氏菌(Klebsiella pneumoniae),序列數14條,基因組覆蓋0.038048%。

 

  據文獻報道,顱內損傷并發顱內感染常見的致病菌為表皮葡萄球菌、溶血葡萄球菌、鮑氏不動桿菌、肺炎克雷伯菌和銅綠假單胞菌。這與我們檢出的肺炎克雷伯菌(Klebsiella pneumoniae)高度吻合。同時有研究發現,腸球菌屬微生物也是引起血流感染的致病菌,其中腸球菌血流感染的主要基礎疾病包括心臟病、膿毒癥、肺部疾病以及神經系統疾病等,屎球菌血流感染的主要基礎疾病包括肝、膽、胰腺以及各種腫瘤、肺部疾病等,這與患者的臨床癥狀也比較相似,給臨床提供了更多的參考價值。

 

  知識小課堂-腸球菌(Enterococcus faecium)

 

  病原學特點:

 

  腸球菌(Enterococcus)屬于腸球菌屬,隸屬于細菌域,厚壁菌門,芽孢桿菌綱,腸球菌科。為革蘭氏陽性球菌,圓形或卵圓形,呈單個、成對或短鏈狀排列,無莢膜,不形成芽孢,部分菌株有稀疏鞭毛。

 

  臨床意義:

 

  腸球菌分布在各種環境中,從土壤、食品、水、動物和植物均可以分離得到,存在于人和動物上呼吸道、消化道、生殖道內。腸球菌屬可以引起盆腔感染、免疫力低下宿主的機會感染 、泌尿道感染(UTI)、血流感染(BSI)和感染性心內膜炎等疾病,是醫院感染重要病原菌。全球腸球菌血流感染(EBSI)流行趨勢正在發生變化,國外報道 EBSI占 9%,位列第 3,僅次于凝固酶陰性葡萄球菌 (CNS)和金黃色葡萄球菌(金葡菌) 。國內早期研究中EBSI占所有BSI病原菌2 %左右。

 

  腸球菌在臨床感染多見,是革蘭陽性菌中比較“奇葩”的病原菌,幾乎能引起全身所有部位感染,近年來隨著腸球菌感染的不斷增多,以及萬古霉素和廣譜抗生素的使用,屎腸球菌比例逐步上升,復雜的耐藥機制和廣泛的天然耐藥、獲得性耐藥直接導致了臨床用藥的失誤,在低年資醫生中尤甚。這樣一個在臨床處理棘手的病原菌竟然屬益生菌的范疇,可作為微生物制劑使用。因此,對待腸球菌應有一個合理的認知,在面對腸球菌感染時臨床應合理的選用抗生素,以有效應對感染和預防耐藥。

 

  用藥建議:

 

  腸球菌常對多種抗生素耐藥,腸球菌體外藥敏顯示對氨芐西林保持相當的敏感性,對氨芐西林的敏感率在80%~85%,對萬古霉素敏感,耐藥率不超過5%,提示治療腸球菌感染時經驗治療仍可選擇氨芐西林作為首選藥物,對于腸球菌重癥感染可聯合萬古霉素。一般在臨床治療時多聯合用藥,首選青霉素或氨芐西林與氨基糖苷類的聯合,也可選擇萬古霉素(或去甲萬古霉素)聯合氨基糖苷類。對老年人、兒童、妊娠婦女等特殊人群,選擇使用抗生素時必須倍加注意。

 

  參考文獻

 

  1. 艾克拜爾 加馬力,關玉華,曹瑩瑩。中樞神經系統感染病原菌臨床分析[J].中國醫院感染學雜志,2013,23(15):3778-3779.
  2. 周庭銀主編.臨床微生物學診斷與圖解:上海科學技術出版社,2012.05:144-146.
  3. 黃仁剛,楊興祥,喻華,龍姍姍,林健梅,江南.腸球菌屬血流感染92例臨床及病原菌特點分析[J].中國感染與化療雜志,2015,15(1):6-10.
  4. 陳亮,李真,劉穎,白鷺,劉佳.腸球菌血流感染的臨床特征和預后因素分析[J].中華醫院感染學雜志,2017,27(9):1944-1947.
  5. 吳昊 劉泉波 鄭銳.腸球菌血流感染研究進展.《中國微生態學雜志》2019年第2期246-249.
  6. Jordi Rello, Laura Campogiani,and Vandana Kalwaje Eshwara.Understanding resistance in enterococcal infections.Intensive Care Medicine volume 46, pages353–356(2020).

 

 關于金匙醫學

 

  “金匙Genskey”取“基因鑰匙”的含義,寓意企業以基因科技作為破解感染診斷難題的金鑰匙。金匙醫學研發中心坐落于北京中關村昌平生命科學園,是中關村高新企業,第三方醫學檢驗所分別位于天津、上海,另在天津建有GMP車間,生產病原診斷醫療器械。金匙醫學的核心技術是感染病原高通量檢測技術,為廣大醫療工作者提供全面、準確、快速的病原微生物檢測產品及服務。

 

  金匙醫學與中日友好醫院、北京大學人民醫院、四川大學華西醫院等頂級醫院建立了深入合作關系,面向呼吸、血液、檢驗等科室,提供病原微生物宏基因組診斷產品及檢測服務的整體解決方案。

 

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