金識原(GenseqPM)感染病原高通量檢測

金匙醫學案例追蹤三十一:迷霧重重,mNGS撥云見日顯晴天

  • 分類:診斷案例
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  • 來源:
  • 發布時間:2020-12-18 10:35
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【概要描述】患者李某,男,74歲 。入院時間:2020-04-20,入住耳鼻喉科。肺泡灌洗液行mNGS檢測,肺泡灌洗液mNGS檢測結果與痰培養的結果高度契合,結合患者病史、體征考慮多重耐藥的鮑曼不動桿菌、肺炎克雷伯菌皆為致病菌,為混合感染,且存在耐藥情況。調整抗感染方案,患者好轉

金匙醫學案例追蹤三十一:迷霧重重,mNGS撥云見日顯晴天

【概要描述】患者李某,男,74歲 。入院時間:2020-04-20,入住耳鼻喉科。肺泡灌洗液行mNGS檢測,肺泡灌洗液mNGS檢測結果與痰培養的結果高度契合,結合患者病史、體征考慮多重耐藥的鮑曼不動桿菌、肺炎克雷伯菌皆為致病菌,為混合感染,且存在耐藥情況。調整抗感染方案,患者好轉

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詳情

  1. 病史及主訴

 

  患者李某,男,74歲 。入院時間:2020-04-20,入住耳鼻喉科。

 

  主 訴:摔傷致面部、左腕部疼痛3小時

 

  現病史:入院前3小時上樓時不慎摔倒,致面部疼痛,流血,伴頭痛、頭暈,伴惡心、嘔吐,嘔吐物為含有暗紅色血液的胃內容物,左腕關節疼痛。

 

  既往史:“腦梗塞、腦出血”病史10余年,遺留言語不利、左下肢無力后遺癥。“高血壓、糖尿病”病史6年,血壓、血糖未規范化治療、管理。

 

  入院查體:神志清、精神差,言語欠流利。T36.8℃,HR99次/分,R16次/分, BP177/80mmHg。左側顴弓處可見長約4cm傷口,深達骨質,活動性出血,中度污染,壓痛陽性,左側面部多處皮膚擦傷,左側上下眼瞼高度腫脹,眶周青紫腫脹。咽部可見陳舊性血性分泌物。

 

  輔助檢查:WBC10.58x10^9/L,N 92.8%,L 3.6%,PLT 78x10^9/L。CRP<10mg/L,hsCRP<0.5mg/L。生化、凝血等大致正常。胸部CT示:雙下肺間質增生伴炎癥。頭顱CT未見出血征象。

 

  2. 診治經過

 

  4月21日患者出現煩躁不安,意識模糊,全身發抖,SPO2 80%-85%,HR130次/分左右,BP160/80mmHg左右。口腔可見較多的血性分泌物,雙肺可聞及痰鳴音,雙下肢可見皮膚花斑。考慮病情危重轉入ICU治療。急查血氣示(FiO241%):pH 7.471, PCO226.3mmHg, PO2 44mmHg ,BE -5mmol/L ,lac 5.56mmol/L。APACHEII評分 24分。診斷:1.肺部感染 2.I型呼吸衰竭 3.面部挫裂傷 4.頜面多發骨折 5.左眼瞼挫傷 6.左橈骨遠端骨折 7.高血壓病 8.腦出血后遺癥期 9.多發腔隙性腦梗塞 10.2型糖尿病。行氣管插管,呼吸機輔助呼吸,送檢病原學標本。考慮患者存在誤吸,經驗性給予注射用哌拉西林鈉他唑巴坦鈉4.5g/q8h抗感染治療后,患者神志清楚,體溫恢復正常,復查血常規、血氣恢復正常。于4月25日脫機拔除氣管插管。拔管后,患者痰液較多。

 

  4月28日纖維支氣管鏡檢查:氣道內多處可見粘膜白斑。夜間體溫39.9℃,給予氟康唑注射液抗真菌治療。同時加用左氧氟沙星注射液0.4g /qd抗感染治療后患者體溫較前下降。

 

  5月5日再次間斷出現發熱,停用氟康唑、左氧氟沙星注射液,換用莫西沙星注射液250ml/qd抗感染治療。

 

  5月10日痰液較前明顯增加,黃色粘稠,痰涂片提示:大量G-菌。CRP13.5mg/L,hsCRP>10mg/L。血常規:WBC 22.95x10^9/L,N 94.2%,L 3%。調整抗感染方案為:莫西沙星注射液+頭孢哌酮鈉舒巴坦鈉3g/q8h。

 

  5月11晚意識障礙程度較前加重,呼吸費力,血壓80/50mmHg,血氣提示II型呼吸衰竭,再次行氣管插管呼吸機輔助呼吸,給予多巴胺、去甲腎上腺素穩定血壓。

 

  5月12日血常規:WBC30x10^9/L,N95.2%,L 1.6%,PCT 1.67ug/L。痰培養回報:肺炎克雷伯桿菌,中量。

 

  5月15日送檢的痰標本5月18日回報:鮑曼不動桿菌(多重耐藥),菌落計數4+,大量;肺炎克雷伯菌,菌落計數4+,大量。且皆可見大量白細胞吞噬現象。

 

  5月15日送肺泡灌洗液行mNGS檢測,5月18日檢測結果報告:

 

  肺泡灌洗液mNGS檢測結果與痰培養的結果高度契合,結合患者病史、體征考慮多重耐藥的鮑曼不動桿菌、肺炎克雷伯菌皆為致病菌,為混合感染,且存在耐藥情況。抗感染方案調整為:注射用硫酸多黏菌素B 100U/q12h+頭孢哌酮鈉舒巴坦鈉3g/q6h。

 

  調整抗感染治療方案后,患者精神較前明顯好轉,痰液較前減少。體溫較前下降,脫機時間延長。感染指標較前下降。復查鏡下痰標本:未檢出鮑曼不動桿菌,可見極少量肺炎克雷伯菌。后成功脫機拔管,患者生命體征平穩,一般情況較前改善。

 

  3. 診治體會

 

  mNGS為重癥感染患者致病微生物的確定提供了重要依據,為臨床診療方案的優化提供了有力的證據,提高了治療的時效性和有效性。同時mNGS還檢出OXA-73 和ADC-82耐藥基因,對頭孢菌素類、青霉烷等耐藥,與臨床培養結果鮑曼不動桿菌(多重耐藥)高度一致,另外宏基因組測序還可以提示其他種類的細菌、病毒等參考信息(如本案例中腸球菌與之前培養結果也是高度一致),展示了宏基因組測序在臨床診斷中“一網打盡”的優勢。可以幫助醫生快速、精準的找到致病菌,為臨床的治療提供有效的治療幫助。

 

  在很多臨床治療的過程中,微生物室的培養技術、條件不同,導致對細菌、真菌等檢出率不同,同時后續的藥敏試驗也有眾多不確定因素,給臨床病原菌的確定帶來了不小的困惑。mNGS技術的使用可以彌補目前臨床上眾多傳統技術的不足,目前已經成長為傳統微生物檢測手段的有力補充,今后一定會在臨床工作中發揮重要作用。

 

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 關于金匙醫學

 

  “金匙Genskey”取“基因鑰匙”的含義,寓意企業以基因科技作為破解感染診斷難題的金鑰匙。金匙醫學的核心技術是感染病原高通量檢測技術,為廣大醫療工作者提供全面、準確、快速的病原微生物檢測產品及服務。金匙醫學研發中心坐落于北京中關村昌平生命科學園,是中關村高新企業,第三方醫學檢驗所分別位于北京、天津、上海、廣州,另在天津建有GMP車間,生產病原診斷醫療器械。

 

  金匙醫學已獲得數個I類,II類注冊證,2項已授權發明專利,二十余項計算機軟著。并與多家頂級臨床院所深入合作,發表4篇高分SCI文章。在新型冠狀病毒疫情期間,金匙醫學聯合四川大學華西醫院開展SARS-Cov-2變異分析研究,并在國際病毒學權威雜志Journal ofVirology發表合作研究論文。

 

  金匙醫學與中日友好醫院、北京大學人民醫院、首都醫科大學附屬北京同仁醫院、四川大學華西醫院、中國醫學科學院血液學研究所血液病醫院、河南省腫瘤醫院、陸道培醫療集團等頂級院所建立了深入合作關系,面向呼吸、血液、檢驗、重癥、感染等科室,提供病原微生物宏基因組診斷產品及檢測服務的整體解決方案。

 

  金匙醫學開發的“新型冠狀病毒(2019-nCoV)IgM/IgG抗體檢測試劑盒(膠體金法)”、“新型冠狀病毒(2019-nCoV)核酸檢測試劑盒(熒光PCR法)”和“新型冠狀病毒(2019-nCoV)核酸檢測試劑盒(可逆末端終止法)”均已取得CE準入資格。2020年7月,金匙醫學研發的病原微生物測序數據分析軟件”成功獲得醫療器械注冊證,該軟件提供包括細菌、支原體、衣原體、立克次氏體、螺旋體、病毒以及真菌的最全類別病原信息,將為臨床感染性疾病的診治提供重要且更為全面的參考。

 

  金匙醫學已獲得國家級科技型中小企業、天津市雛鷹企業、天津市戰略性新興產業領軍企業等榮譽稱號;在CHC醫療咨詢聯合中信證券在線發布的“2019年度中國醫療大健康產業投融資榮譽榜”中榮獲“中國醫療健康產業最佳新銳獎”;在“2020年中關村國際前沿科技創新大賽”中榮登“病毒檢測技術專場TOP10榜單”,同時在2020年榮獲國家高新技術企業稱號。

 

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