金識原(GenseqPM)感染病原高通量檢測

金匙醫學案例追蹤二十九:mNGS助力精準診斷,老年咳嗽患者揪出真兇

【概要描述】老年男性,因雙下肢疼痛1周,發現肌酐升高。肺泡灌洗液DNA流程結果:惠普爾養障體序列數24條,CMV序列數1條,腎臟鉤端螺旋體序列數47條。RNA流程結果:惠普爾養障體序列數1條,腎臟鉤端螺旋體序列數77條。考慮為:鉤端螺旋體感染。26日起停用泰能、奧司他韋及科賽斯,改用青霉素150萬單位q8h抗感染,經治療后患者熱峰、CRP及PCT等相關感染指標明顯好轉。

金匙醫學案例追蹤二十九:mNGS助力精準診斷,老年咳嗽患者揪出真兇

【概要描述】老年男性,因雙下肢疼痛1周,發現肌酐升高。肺泡灌洗液DNA流程結果:惠普爾養障體序列數24條,CMV序列數1條,腎臟鉤端螺旋體序列數47條。RNA流程結果:惠普爾養障體序列數1條,腎臟鉤端螺旋體序列數77條。考慮為:鉤端螺旋體感染。26日起停用泰能、奧司他韋及科賽斯,改用青霉素150萬單位q8h抗感染,經治療后患者熱峰、CRP及PCT等相關感染指標明顯好轉。

詳情

  1、基本資料

 

  老年男性,因雙下肢疼痛1周,發現肌酐升高2天于2020-10-22入院。患者訴下肢疼痛,伴咳嗽,時有咳痰,痰中帶血絲,外院查肌酐升高,具體不詳。患者訴既往有甲肝病史,已治愈。1966年因右大腿粉瘤行手術切除。入院查體:T 36.8℃,雙肺可聞及濕羅音,無干啰音及胸膜摩擦音,其余查體未見明顯異常。

 

  2、入院后的檢查結果和診斷

 

  入院查血常規:WBC11.72*109/L,CRP 252.94mg/L.,PCT 4.59 pg/ml。

  肺CT:雙肺彌漫性滲出。

  結合相關感染指標與肺CT檢查結果,初步考慮是肺部感染,但是病因尚不明確。

  完善肺部CT后提示雙肺彌漫性滲出,初步考慮是肺部彌漫性肺泡出血或間質感染。但此時患者的熱峰不高,最高37.9℃,相關感染指標提示WBC約11.72*109,CRP252.94mg/L.,PCT4.59 pg/ml。結合相關感染指標與肺CT檢查結果,考慮兩者并不一致,CT結果更為嚴重。當時的初步考慮是肺部感染,但是感染源并不明確,而且常見的病原體感染的話難以解釋為何早期就會出現肌酐異常。

 

  3、mNGS檢測前治療方案與效果

 

  因考慮肺部感染,初始治療方案是泰能抗細菌感染、奧司他韋抗病毒及科賽斯覆蓋真菌治療,但患者入院后出現發熱,體溫升高至37.9℃,且復查CRP升高,PCT無降低。結合相關感染指標與肺CT檢查結果,考慮兩者并不一致,CT結果更為嚴重。遂行纖維支氣管鏡下可見大量紅色泡沫樣痰。為進一步明確診斷,遂留取肺泡灌洗液行mNGS檢測。

 

  4、mNGS檢查結果

 

  24小時后肺泡灌洗液DNA流程結果:惠普爾養障體序列數24條,CMV序列數1條,腎臟鉤端螺旋體序列數47條。RNA流程結果:惠普爾養障體序列數1條,腎臟鉤端螺旋體序列數77條。

 

 5、mNGS回報后治療方案與效果

 

  根據結果mNGS結果,進一步詢問患者家屬,患者飼養了3只大型犬,以及數十只貓,有鉤端螺旋體感染的可能途徑;同時患者肺泡出血及肌酐異常亦可通過鉤端螺旋體感染來解釋,考慮病原體基本明確。考慮為:鉤端螺旋體感染。26日起停用泰能、奧司他韋及科賽斯,改用青霉素150萬單位q8h抗感染,經治療后患者熱峰、CRP及PCT等相關感染指標明顯好轉。

 

  6、治療體會

  通過本次的病例,感受到mNGS的第一個好處是,時效非常快!在留取mNGS標本時,我們同時留取靜脈血樣本做鉤端螺旋體的檢測,但因為醫院檢驗科沒有檢測的機器及試劑,只能外送到廣州市CDC進行檢測。但CDC的結果報告回復甚晚,直至mNGS報告出來后2天,CDC的結果仍未出!而mNGS在取標本后24小時內就出結果!可以說沒有早期快速的診斷報告,就無法早期有針對性地使用抗感染治療。第二點感觸是mNGS特異性高,非常準!此外,針對此類CT結果與臨床相關證據不一致的情況,臨床上很多時候都是“先開槍后瞄準”,早期經驗性廣譜抗感染治療藥物的使用,很多時候是不得已而為,一方面是容易誘導耐藥菌的產生,使得后續抗感染治療方案束手束腳;另一方面是多種抗菌藥物的使用,加重患者肝腎功能負擔,進而引起藥物性肝腎損害,影響患者預后。在本病歷中,mNGS可以說是指引抗菌治療的“瞄準鏡”,通其準確及快速的報告協助診斷,為盡早地開展針對性地治療爭取了寶貴的時間。

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  關于金匙醫學

 

  “金匙Genskey”取“基因鑰匙”的含義,寓意企業以基因科技作為破解感染診斷難題的金鑰匙。金匙醫學的核心技術是感染病原高通量檢測技術,為廣大醫療工作者提供全面、準確、快速的病原微生物檢測產品及服務。金匙醫學研發中心坐落于北京中關村昌平生命科學園,是中關村高新企業,第三方醫學檢驗所分別位于北京、天津、上海、廣州,另在天津建有GMP車間,生產病原診斷醫療器械。

 

  金匙醫學已獲得數個I類,II類注冊證,2項已授權發明專利,二十余項計算機軟著。并與多家頂級臨床院所深入合作,發表4篇高分SCI文章。在新型冠狀病毒疫情期間,金匙醫學聯合四川大學華西醫院開展SARS-Cov-2變異分析研究,并在國際病毒學權威雜志Journal ofVirology發表合作研究論文。

 

  金匙醫學與中日友好醫院、北京大學人民醫院、首都醫科大學附屬北京同仁醫院、四川大學華西醫院、中國醫學科學院血液學研究所血液病醫院、河南省腫瘤醫院、陸道培醫療集團等頂級院所建立了深入合作關系,面向呼吸、血液、檢驗、重癥、感染等科室,提供病原微生物宏基因組診斷產品及檢測服務的整體解決方案。

 

  金匙醫學開發的“新型冠狀病毒(2019-nCoV)IgM/IgG抗體檢測試劑盒(膠體金法)”、“新型冠狀病毒(2019-nCoV)核酸檢測試劑盒(熒光PCR法)”和“新型冠狀病毒(2019-nCoV)核酸檢測試劑盒(可逆末端終止法)”均已取得CE準入資格。2020年7月,金匙醫學研發的病原微生物測序數據分析軟件”成功獲得醫療器械注冊證,該軟件提供包括細菌、支原體、衣原體、立克次氏體、螺旋體、病毒以及真菌的最全類別病原信息,將為臨床感染性疾病的診治提供重要且更為全面的參考。

 

  金匙醫學已獲得國家級科技型中小企業、天津市雛鷹企業、天津市戰略性新興產業領軍企業等榮譽稱號;在CHC醫療咨詢聯合中信證券在線發布的“2019年度中國醫療大健康產業投融資榮譽榜”中榮獲“中國醫療健康產業最佳新銳獎”;在“2020年中關村國際前沿科技創新大賽”中榮登“病毒檢測技術專場TOP10榜單”,同時在2020年榮獲國家高新技術企業稱號。

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