金識原(GenseqPM)感染病原高通量檢測

金匙醫學案例追蹤二十四:慢性阻塞性肺病伴肺膿腫,mNGS抽絲剝繭探真兇

  • 分類:診斷案例
  • 作者:
  • 來源:
  • 發布時間:2020-10-18 10:12
  • 訪問量:

【概要描述】 患者男,78歲,主訴:反復咳嗽、咳痰、氣促10年,加重伴發熱2天。鏡下留取肺泡灌洗液送痰培養及NGS檢測

金匙醫學案例追蹤二十四:慢性阻塞性肺病伴肺膿腫,mNGS抽絲剝繭探真兇

【概要描述】 患者男,78歲,主訴:反復咳嗽、咳痰、氣促10年,加重伴發熱2天。鏡下留取肺泡灌洗液送痰培養及NGS檢測

  • 分類:診斷案例
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  • 發布時間:2020-10-18 10:12
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詳情

  1、病史及主訴

 

  患者男,78歲,于2020-6-9日入院,既往鼻咽癌并行放化療史。主訴:反復咳嗽、咳痰、氣促10年,加重伴發熱2天。現病史:患者10年前起無明顯誘因漸出現咳嗽,咯少量白色粘痰,伴活動后氣促,無喘鳴,多發于秋冬季及天氣變化時,每年發作累計多于3個月,聞到刺激性氣味無誘發咳嗽,氣喘,無潮熱、盜汗,無咯濃痰、血痰等不適,曾于本院住院,診斷“慢性阻塞性肺疾病”,長期門診治療,癥狀時有反復。2天前咳嗽、氣促加重,咯較多黃痰,伴發熱,體溫最高38.5℃,無胸悶、胸痛,無夜間陣發性呼吸困難,無全身酸痛等不適,遂到我院急診就診,胸片示雙肺感染,新冠病毒核酸未檢出,今入院進一步治療。本次起病以來,患者無畏寒發熱,無胸悶胸痛,精神胃納一般,大小便正常,近期體重無明顯下降。

 

  2、診治過程

 

  入院后體查

 

  患者體溫36.5℃,脈搏86次/分,血壓125/68mmHg,呼吸:20次/分,患者神清,體型消瘦,頸軟,氣管位置居中,桶狀胸,肋間隙增寬,呼吸音稍弱,雙下肺聞少量濕啰音,心率86次/分,心律規則,律齊,心音正常,各瓣膜聽診區未聞及雜音,雙下肢無水腫。2020-6-9日急診床邊胸片提示:1.肺氣腫;雙肺多發肺大泡形成,大致同前。2.考慮雙肺輕度感染,部分纖維灶,請治療后復查。3.主動脈硬化、迂曲,同前。4.胸椎退行性變,同前。入院后完善相關檢查:血常規:中性粒細胞百分比88.9%↑;白細胞計數22.05* 10^9/L↑;紅細胞計數4.13*10^12/L↓;血氣分析:實測酸堿度7.489↑;測定二氧化碳分壓4.46kPa↓;PRO-BNP619pg/ml↑;PCT 1.39ng/ml↑;紅細胞沉降率97mm/h↑。

 

  3、現行治療方案與效果

 

  入院后予頭孢他啶注射液抗感染,并予化痰、擴張支氣管等治療,患者仍有氣促,活動后為主,且反復發熱,考慮頭孢他啶抗感染效果欠佳,遂于2020-6-12日更改為哌拉西林他唑巴坦注射液抗感染,并于2020-6-16日完善胸部CT提示:1.右肺上中葉大量感染,考慮膿腫形成,請治療后復查。2.肺氣腫;雙肺多發肺大泡形成,大致同前。3.雙肺慢性間質性改變大致如前;雙肺少許纖維增殖灶。4.右肺門及縱隔淋巴結輕度腫大。5.右側胸膜增厚,右側胸腔少量積液。考慮患者肺感染嚴重,合并肺膿腫,于2020-6-19日完善氣管鏡檢查,鏡下留取肺泡灌洗液送痰培養及NGS檢測。

 

  4、mNGS檢查

 

  6月21日外周血mNGS回報:銅綠假單胞菌,小細環病毒18型

 

  BALF的mNGS回報:

 

  細菌:鮑曼不動桿菌桿菌,101375序列

 

  糞腸球菌,10522序列

 

  銅綠假單胞菌,7514序列

 

  嗜麥芽窄食單胞菌,188序列

 

  真菌:白色念珠菌3090序列,黃曲菌序列1

 

  病毒:人類皰疹病毒5型(CMV)26序列,人類皰疹病毒4型(EBV)13序列;人多瘤病毒7型12序列

 

  耐藥基因檢出列表:OXA-73(Klebsiella pneumonia 肺炎克雷伯菌) 31序列;OXA-50(Pseudomonas aeruginosa 銅綠假單胞菌) 20序列,同時2020-6-22日痰培養提示:銅綠單胞菌生長,鮑曼不動桿菌復合菌生長(多重耐藥,耐哌拉西林他唑巴坦,耐亞胺培南,耐頭孢哌酮舒巴坦;耐左氧氟沙星,對替加環素敏感)

 

  血液mNGS結果:

 

 

  BALF的mNGS結果:

 

 

  6、治療體會

  該患者是一名慢性阻塞性肺疾病患者,病史多年,平素肺功能欠佳,且有鼻咽癌病史,體質欠佳,此次因感染加重入院,CT提示肺部感染明顯進展合并肺膿腫,經血及BALF標本的NGS送檢,可在最短時間內獲取到病原菌的信息,對臨床抗生素的指導治療具有重要意義,尤其適用于重癥感染的患者或發熱原因不明及特殊病原體感染的患者。

 

 

  另外mNGS對細菌耐藥也給出了良好提示。在醫院的痰培養報告中,鮑曼不動桿菌對頭孢、哌拉西林耐藥,符合mNGS回報的耐藥檢出。mNGS檢出銅綠假單胞菌對青霉烷類耐藥,痰培養回報對二代頭孢耐藥,對替卡西林·克拉維酸為中敏,對環丙沙星、阿米卡星等敏感,結合臨床用藥效果,也是符合的。

 

  關于金匙醫學

 

  “金匙Genskey”取“基因鑰匙”的含義,寓意企業以基因科技作為破解感染診斷難題的金鑰匙。金匙醫學的核心技術是感染病原高通量檢測技術,為廣大醫療工作者提供全面、準確、快速的病原微生物檢測產品及服務。金匙醫學研發中心坐落于北京中關村昌平生命科學園,是中關村高新企業,第三方醫學檢驗所分別位于北京、天津、上海、廣州,另在天津建有GMP車間,生產病原診斷醫療器械。

 

  金匙醫學已獲得數個I類,II類注冊證,2項已授權發明專利,二十余項計算機軟著。并與多家頂級臨床院所深入合作,發表4篇高分SCI文章。在新型冠狀病毒疫情期間,金匙醫學聯合四川大學華西醫院開展SARS-Cov-2變異分析研究,并在國際病毒學權威雜志Journal ofVirology發表合作研究論文。

 

  金匙醫學與中日友好醫院、北京大學人民醫院、首都醫科大學附屬北京同仁醫院、四川大學華西醫院、中國醫學科學院血液學研究所血液病醫院、河南省腫瘤醫院、陸道培醫療集團等頂級院所建立了深入合作關系,面向呼吸、血液、檢驗、重癥、感染等科室,提供病原微生物宏基因組診斷產品及檢測服務的整體解決方案。

 

  金匙醫學開發的“新型冠狀病毒(2019-nCoV)IgM/IgG抗體檢測試劑盒(膠體金法)”、“新型冠狀病毒(2019-nCoV)核酸檢測試劑盒(熒光PCR法)”和“新型冠狀病毒(2019-nCoV)核酸檢測試劑盒(可逆末端終止法)”均已取得CE準入資格。2020年7月,金匙醫學研發的病原微生物測序數據分析軟件”成功獲得醫療器械注冊證,該軟件提供包括細菌、支原體、衣原體、立克次氏體、螺旋體、病毒以及真菌的最全類別病原信息,將為臨床感染性疾病的診治提供重要且更為全面的參考。

 

  金匙醫學已獲得國家級科技型中小企業、天津市雛鷹企業、天津市戰略性新興產業領軍企業等榮譽稱號;在CHC醫療咨詢聯合中信證券在線發布的“2019年度中國醫療大健康產業投融資榮譽榜”中榮獲“中國醫療健康產業最佳新銳獎”;在“2020年中關村國際前沿科技創新大賽”中榮登“病毒檢測技術專場TOP10榜單”。

 

 

 

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